Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GRIN2CQ14957 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GRIN2CQ14957 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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