Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RFTN1Q14699 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RFTN1Q14699 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms