Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
GBX1Q14549 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms