Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TRIM25Q14258 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRIM25Q14258 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms