Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LAMB3Q13751 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LAMB3Q13751 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms