Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMAD4Q13485 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms