Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
FOXE3Q13461 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
FOXE3Q13461 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms