Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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ITGB3BPQ13352 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ITGB3BPQ13352 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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