Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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CLN3Q13286 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CLN3Q13286 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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