Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DUSP4Q13115 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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