Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SREBF2Q12772 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SREBF2Q12772 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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