Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
AP1B1Q10567 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
AP1B1Q10567 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms