Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSME1Q06323 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms