Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CHRNEQ04844 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms