Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP7AQ04656 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP7AQ04656 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms