Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms