Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAM3AP98173 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAM3AP98173 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms