Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
JAG1P78504 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
JAG1P78504 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
JAG1P78504 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms