Protein–RNA interactions for Protein: P61077

UBE2D3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D3P61077 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
UBE2D3P61077 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms