Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms