Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NMUP48645 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NMUP48645 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NMUP48645 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NMUP48645 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NMUP48645 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NMUP48645 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NMUP48645 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NMUP48645 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 ASB7-201ENST00000332783 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 MSH6-210ENST00000540021 3930 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NMUP48645 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 REV3L-201ENST00000358835 10815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NMUP48645 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NMUP48645 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NMUP48645 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NMUP48645 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NMUP48645 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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NMUP48645 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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NMUP48645 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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NMUP48645 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
NMUP48645 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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