Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGAEP38570 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGAEP38570 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms