Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBRP36941 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBRP36941 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBRP36941 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBRP36941 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LTBRP36941 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LTBRP36941 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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LTBRP36941 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LTBRP36941 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LTBRP36941 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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