Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ACTN2P35609 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms