Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HOXA10P31260 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms