Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TSPOP30536 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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