Protein–RNA interactions for Protein: P29074

PTPN4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4P29074 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PTPN4P29074 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms