Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HOXD10P28358 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HOXD10P28358 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms