Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
IL3RAP26951 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms