Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPREP23469 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPREP23469 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPREP23469 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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