Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXB8P17481 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXB8P17481 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms