Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BRAFP15056 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRAFP15056 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRAFP15056 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRAFP15056 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRAFP15056 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BRAFP15056 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms