Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BMP3P12645 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms