Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM225BP0DP42 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms