Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BP0C0L5 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BP0C0L5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms