Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RHOP08100 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RHOP08100 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms