Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF208O43345 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 550 ms