Protein–RNA interactions for Protein: O00488

ZNF593, Zinc finger protein 593, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF593O00488 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
ZNF593O00488 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms