Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms