Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ARID3CA6NKF2 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms