Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 MNT-201ENST00000174618 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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