Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C2

TCAF1, TRPM8 channel-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF1Q9Y4C2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TCAF1Q9Y4C2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms