Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SH3BP1Q9Y3L3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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