Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HOXC10Q9NYD6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXC10Q9NYD6 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
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