Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ROPN1BQ9BZX4 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms