Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYCP2Q9BX26 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms