Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIRIP3Q9BW71 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIRIP3Q9BW71 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms