Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
C2orf48Q96LS8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
C2orf48Q96LS8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms