Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC1

VPS39, Vam6/Vps39-like protein, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VPS39Q96JC1 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
VPS39Q96JC1 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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VPS39Q96JC1 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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VPS39Q96JC1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
VPS39Q96JC1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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