Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHFRQ96EP1 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms